La Dirección de Auditorías del Tribunal Superior de Cuentas está compuesta por nueve sectores de trabajo que se ocupan de fiscalizar las instituciones públicas que se encuentran dentro de su ámbito de trabajo.
Unidad encargada de evaluar y dar seguimiento al cumplimiento de las recomendaciones emitidas por a firma auditora PriceWaterHouseCoopers y la Oficina Normativa de Contratación y Adquisición del Estado (ONCAE)